器官移植是難度甚高且嚴謹的手術，尤其是心臟、肺臟、肝臟等重大器官的移植，必須結合整個器官移植團隊的每一項專業(包括臨床內外科、感染科、精神科、麻醉部、藥劑部、護理部、影像醫學部、醫學檢驗部、社會工作室等部門)，因此又被認為是評估醫院整體醫療能力的指標之一。歷經多年來的努力耕耘發展，本院目前已可進行心臟、肝臟、肺臟、腎臟、胰臟、小腸、眼角膜及造血幹細胞移植，是中南部地區唯一完備所有「全器官」移植的醫學中心。
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